Родился в 1934 г. В Трубчевском районе Брянской области. Окончил ВЗЛТИ в Ленинграде (1960). С 1960 г. Работал в Брянском технологическом институте: лекционным ассистентом, преподавателем, доцентом, зав. кафедрой, деканом лесохозяйственного факультета. В 1965 г. защитил кандидатскую диссертацию. С 1966 г. активно занимался исследованием действия химических мутагенов на рост и репродуктивную способность древесных растений. В период с 1980 по 1992 гг. работал старшими научным сотрудником во ВНИИ химизации лесного хозяйства, где последовательно занимал должности зав. лабораторией, зам. директора по научной работе. С 1992  по 2010 гг. – зав. кафедрой садово-паркового и ландшафтного строительства БГИТА, член редколлегии «Лесного журнала», член диссертационного совета БГУ, зам. председателя диссертационного совета БГИТА. Подготовил 5 докторов наук и 15 кандидатов наук.

Под руководством Е.Н. Самошкина десятки воспитанников кафедры достигли значимых результатов в науке и производстве. До последних дней жизни Е.Н. Самошкин возглавлял научное направление кафедры – исследование действия химических мутагенов, выявлением их мутагенного и стимулирующего  эффекта на древесных растениях.  В содружестве с институтом экологии МИА  сотрудниками кафедры во главе с Е.Н. Самошкиным  активно проводились исследования по единой госпрограмме, связанной с защитой населения РФ от воздействия  Чернобыльской катастрофы.

Под руководством профессора Е.Н. Самошкина сотрудники кафедры  участвовали в экологических исследованиях и разработке проектов по озеленению г. Брянска,  благоустройства его  территорий.

Образ ученого, педагога, организатора науки Егора Никитича Самошкина навсегда останется в памяти его учеников, коллег и последователей.